博康医疗帮助南方科技大学医院建设智能体检系统，实现医院体检科室以及各专业体检机构日常健康体检业务的标准化、规范化、网络化、信息化、智能化统一管理。

南方科技大学医院是南山区政府投资、南方科技大学运营管理的集医疗、教学、科研、健康促进、人才培养和国际交流为一体的三级综合性公立医院。

2017年12月28日，南山区政府与南方科技大学签署合作共建医院协议，为国内独特的政府主导、大学托管、管办分开、理事会制、法人治理的现代医院运营管理新模式。2019年11月，医院晋升为三级综合医院。医院占地面积2.66万平方米，一期建筑面积近10万平方米，可展开病床800张；已启动二期工程建设，未来五年内，将达到总建筑面积22万平方米、1500张床位规模。2019年12月28日，医院全面建设启动。2020年12月，在政校合作建院三周年之际，医院揭牌“南方科技大学第三附属医院”。创新提出“3P3S”理念（即Preventive预防性、Proactive主动性、Precise精确性、Systemati系统化、Standardized标准化、Scientific科学化），打造以“理念文化创新、管理机制创新、机构设置创新、绩效管理创新、技术建设创新”为核心的南科医模式。